Какой-то маленький чертенок внутри меня подсказывает, что обновлялись не порты, а сама система. И пропустили шаг с компиляцией ядра... Собственно соль проблемы в том, что загрузчик не может найти ядро для загрузки.
Для начала попробуйте подгрузить старое ядро (если есть такое):
OK load /boot/kernel.old/kernel
Ну и после этого даем команду загрузки:
boot
Эта проблема уже рассматривалась по этой ссылке:
http://muff.kiev.ua/content/zagruzka-sistemy-so-starym-yadromЕсли старое ядро успешно загрузилось - запускайте сборку нового:
1. cd /usr/src
2. make buildkernel KERNCONF=
YOUR_KERNEL_HERE (default is GENERIC).
4. make installkernel KERNCONF=
YOUR_KERNEL_HERE (default is GENERIC).